Сайт бібліотеки  >  Електронний каталог  >  Опис документа

Опис документа

Андронов Е. Е., Онищук О. П., Курчак О. Н., Проваров Н. А.
Изменение популяционной структуры ризобий клевера (rhizobium leguminosarum bv. Trifolii) при переходе из почвы в клубеньковую нишу

Вид документа:  Складова частина документа 
Мова:  Російська  Обсяг:  С. 500-508 
УДК:  576.8.095.38:851.155 

Аннотацiя:

С помощью анализа ампликонных библиотек методом высокопроизводительного секвенирования выявлены изменения популяционной структуры ризобий клевера (Rhizobium leguminosarum bv. trifolii) при переходе из почвы в клубеньки растения-хозяина (Trifolium hybridum). При анализе разнообразия ризобий по гену nodA получено 3258 и 1449 нуклеотидных последовательностей (аллельных вариантов) для почвенной и клубеньковой популяций соответственно. Они объединены в 29 операционных таксономических единиц (ОТЕ) по критерию 97% сходства, причем 24 ОТЕ представлены в почвенной, 12 ОТЕ ? в клубеньковой популяции, 7 ОТЕ были общими. В составе доминирующей ОТЕ13 (объединяет 77.4% последовательностей из почвенной и 91.5% из клубеньковой популяции) выявлено 155 “почвенных” и 200 “клубеньковых” вариантов гена nodA, причем их нуклеотидное разнообразие при переходе “почва клубеньки” существенно возрастало. С помощью метода “скользящего окна” выявлены участки гена nodA, в которых при переходе бактерий из почвенной ниши в клубеньки наблюдают резкое возрастание полиморфизма, в том числе связанное с повышением частоты несинонимических замен. В то же время, при анализе индивидуальных штаммов методом ПЦР-анализа показано, что разнообразие ризобий по составу IGS-генотипов при переходе “почва клубеньки” изменилось незначительно. Полученные данные позволяют предположить, что ускорение эволюции ризобий при симбиозе связано с формированием высоко полиморфных вирулентных субпопуляций, подвергаемых движущему отбору в системе “растение?почва”.

Є складовою частиною документа Микробиология [Текст]. Т. 83. № 4 / РАН. — М. : Наука, 2014.

Теми документа

• УДК/5 Математика та природничi науки/57 Бiологiчнi науки в цiлому/576 Клітинна та субклітинна біологія. Цитологія/576.8 Паразитологія